在应对城内尚未完全平息的瘟疫之上。在吴又可和袁班等医士的努力下，疫情虽然得到了初步遏制，但形势依然严峻。崇祯多次召见吴又可等人，对他们不畏艰险、救治病患的功绩表达了高度的赞赏和感激。

当他接到高杰斩杀阿巴泰、并已成功清剿张家口八大蝗商、查抄巨额财富的奏报时，心情大好！“好！高杰果然没有辜负朕的期望！杀伐果断！是员虎将！”

他立刻将这两件“喜事”联系起来，下达了新的旨意：“查，医士吴又可、袁班等人，于京师瘟疫危难之际，悬壶济世，救治万民，功绩卓着！着，即刻任命吴又可为太医院院判（给予实权官职），袁班为太医院御医！其余有功医士，一并录用，赏赐银两！” 他要借着军事胜利的东风，将这些真正有能力的医士，正式纳入朝廷体制，以便更好地推行防疫治瘟之策。

当吴又可等人听闻皇帝要征调他们前往其他疫区（如军营、地方）指导防疫时，崇祯更是给予了全力的支持：“先生尽管放手去做！朕已下旨，西厂、锦衣卫、地方官府，皆需全力配合！所需药材、人力、钱粮，内帑无条件供给！务必……务必将这该死的瘟疫，彻底根除！”

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京师内外，似乎呈现出一种奇特的景象：一方面，皇帝以雷霆手段，对外斩将夺旗，对内严惩贪腐、打击奸商，展现出前所未有的强势与决断，赢得了军心和部分民心；另一方面，瘟疫的阴影尚未散去，朝堂之上因清洗而产生的权力真空和暗流涌动，江南士林对皇帝新政的强烈不满与抵制……种种危机与希望交织，预示着大明王朝的未来，依旧充满了变数与挑战。崇祯皇帝，这位决心要逆天改命的穿越者，正以他独特的方式，驾驶着这艘千疮百孔的巨轮，在惊涛骇浪中，艰难前行。

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