突然发动政变，控制京城，逼迫曹爽交出权力，最后诛杀曹爽及其党羽，手段阴险，违背了忠义之道，被指责为不忠不义。

第二，违背政治契约：司马懿曾对曹爽许下洛水之誓，保证只要曹爽交出权力，就可保其性命与富贵，但最终却违背誓言诛杀曹爽，这一行为使华夏传承千年的诚信崩塌，古代政治契约的信任基础也受到冲击，令后人诟病。

第三，过度屠杀无辜：司马懿在平定辽东公孙渊叛乱时，手段极其残忍。攻破辽东后，他不仅将公孙渊所立的公卿全部诛杀，还杀害了当地十五岁以上的男子七千余人，并将剩余人口收编迁徙到关内，这种大规模的屠杀行为严重违背了人道，给人们留下了极其恶劣的印象。

第四，晋朝统治黑暗：司马懿的孙子司马炎建立晋朝后，西晋初期就爆发了“八王之乱”，司马家族内部为了争夺权力相互攻伐，战乱持续多年，导致社会动荡、经济衰退、民不聊生。西晋灭亡后，东晋时期也是内乱不断，门阀士族专权，政治腐败，社会矛盾尖锐，晋朝的统治未能给百姓带来安定和繁荣。

第五， 引发五胡乱华：西晋时期，由于内部混乱，国力衰弱，对边疆地区的管控能力下降。司马师、司马昭时期为平定叛乱调动了守卫边疆的军队，使得边疆防御空虚，北方的鲜卑、匈奴、羌人等异族趁机纷纷入侵，中原大地陷入长期的战乱与分裂，给百姓带来了沉重的灾难，这被认为是司马懿家族统治不力带来的严重后果。